Skip to main content
Sense categoria

El CNAG participa en la seqüenciació del genoma del meló

By 6 de juliol de 2012novembre 16th, 2020No Comments
< Tornar a notícies
Imatge © Consell Superior d'Investigacions Científiques (CSIC)
 06.07.2012

El CNAG participa en la seqüenciació del genoma del meló

Un consorci de nou centres de recerca públics i privats de cinc comunitats autònomes espanyoles ha obtingut el genoma del meló, una de les espècies de major interès econòmic a tot el món. Els resultats del treball –en què ha col·laborat el , amb seu al Parc Científic de Barcelona– es publiquen a la revista Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) []. És la primera vegada que una iniciativa publico-privada espanyola aconsegueix un genoma complet d'una espècie superior de plantes (que tenen flor i produeixen llavors) i, a més, ho han fet usant noves tecnologies de seqüenciació massiva, que són més barates i eficients.


El projecte –anomenat Melonomics i promogut per la fundació Genoma Espanya– ha estat liderat per Pere Puigdomènech, del Consell Superior d’Investigacions Científiques (CSIC), i Jordi Garcia Mas, l’Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA), que desenvolupen el seu treball al Centre de Recerca en Agrigenòmica de Barcelona (CRAG ). El treball també ha comptat amb una col.laboració molt destacada del grup liderat per Tyler Alioto, del Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica i del grup dirigit per Roderic Guigó, del Centre de Regulació Genòmica.

Els resultats han demostrat que el genoma del meló té 450 milions de parells de bases i 27.427 gens. És molt més gran que el genoma del seu “parent” més proper, el cogombre que té 360 milions de parells de bases.

Un altre aspecte d’interès per a l’estudi és el relacionat amb la maduració de la fruita, procés en el qual es defineixen característiques com el gust i l’aroma. Els científics han identificat fins a 89 gens relacionats amb alguns aspectes d’aquest procés: 26 gens relacionats amb l’acumulació de carotenoides, que li confereixen el color a la polpa del meló i 63 relacionats amb l’acumulació de sucre i el sabor del meló. Vint-i-u d’aquests gens no han estat descrits amb anterioritat.

L’investigador del CNAG, Tyler Alioto, en col·laboració amb el CRG, va encapçalar l’esforç per identificar i assignar funcions a tot el conjunt de gens codificadors de proteïnes en el genoma del meló. Concretament, va crear un conjunt de gens de referència (27.427 gens en total) a partir d’una combinació de prediccions de gens i proves d’expressió gènica. Aquest repertori de gens anotats –que inclou els gens de resistència a malalties i els gens abans esmentats que afecten la qualitat de la fruita– es pot utilitzar com una nova eina per millorar les varietats de meló a través del seu cultiu, així com per ampliar els nostres coneixements sobre l’evolució de la família de les cucurbitáceas.

El CNAG també ha resecuenciado altres varietats de meló, incloent els genomes parentals, que ajuden a identificar la variació genètica entre les diferents varietats.