Sequentia Biotech, amb seu al Parc Científic de Barcelona (PCB), ha llançat al mercat la plataforma cloud computing A.I.R. (Artifical Intelligence RNAseq), la primera eina de predicció bioinformàtica que és capaç d'analitzar, de manera automàtica, dades transcriptòmiques massives (és a dir, vinculades a l’ARN o RNA) del genoma de qualsevol espècie generades per les tecnologies de seqüenciació de nova generació (Next Generation Sequencing, NGS), i proporcionar un informe complet en menys de 24 hores.

La transcriptòmica estudia el transcriptoma, el conjunt de molècules d’àcid ribonucleic (ARN o RNA) que hi ha en una cèl·lula, teixit o òrgan, i que tenen un paper clau en la regulació de l’expressió dels gens i en importants processos de la biologia cel·lular. Els transcriptomes són molt variables perquè proporcionen informació sobre el conjunt de gens que s’estan expressant sota determinades condicions en un moment donat i difereixen considerablement d’una cèl·lula a una altra.

El desenvolupament de les noves tecnologies de seqüenciació del transcriptoma, com ara l’RNA-Seq, han permès avançar en el coneixement de la dinàmica de l’expressió dels gens i en la seva influència en el desenvolupament de molts processos biològics. Els transcriptomes de les cèl·lules canceroses, per exemple, poden ajudar a entendre els processos de carcinogènesi i els de les cèl·lules mare, el desenvolupament i diferenciació cel·lular.

La innovació d’A.I.R. radica que és la primera plataforma d’anàlisi de dades d’RNA-Seq del món capaç de resoldre tres obstacles importants en el camp de la genòmica: la problemàtica de la informàtica (específicament la d’emmagatzematge de dades, automatització de resultats, i durada de l’anàlisi); la problemàtica científica generada per les tecnologies de seqüenciació de nova generació (interpretació i integració de dades, a més d’oferir noves funcions bioinformàtiques i estadístiques); i el problema social (la falta d’eines senzilles a l’abast dels investigadors amb pocs coneixements bioinformàtics).
 

La nova era de la transcriptòmica

Amb el llançament d’A.I.R. Sequentia Biotech posa a disposició de la comunitat científica la possibilitat d’analitzar i comparar, automàticament, mostres d’RNA i interpretar les dades en un mateix programa, d’una manera més minuciosa que altres mètodes existents. Però a més, A.I.R. no es limita a organismes model, sinó que funciona per al genoma seqüenciat de qualsevol espècie, fent servir actualment una base de dades de 45.000 genomes.

La plataforma utilitza els darrers algorismes i mètodes bioinformàtics publicats, i s’actualitza alhora que aquests. A més és escalable, un nombre il·limitat d’usuaris es poden connectar sense comprometre la qualitat i la rapidesa del servei, i qualsevol d’ells poden pujar les seves dades des del seu propi G-drive sense necessitat de connectar-se al núvol.

 “A.I.R. és la primera solució SaaS (Programari as a Service) disruptiva perquè, a més d’estar dissenyada amb mètodes científics robusts, és un programari d’ús molt ràpid i senzill: només es requereixen tres passos i els resultats es poden obtenir en 2 hores i, fins i tot, depenent del tipus i nombre de mostres, el temps es pot reduir a 30 minuts. El cost de l’anàlisi amb A.I.R. és 50 vegades menor que altres mètodes equiparables en qualitat, i a més és automàtic, només cal pujar les dades i definir el genoma de referència de l’espècie, és a dir, no requereix formació especialitzada; qualsevol investigador que no sigui expert en bioinformàtica el pot utilitzar”, explica Walter Sanseverino, cofundador i CEO de Sequentia Biotech.

Sequentia ha aconseguit finançament de l’SME Instrument Phase,1 –en el marc del programa Horizon 2020– en la categoria ‘Open Disruptive Innovation Scheme’ per al projecte A.I.R. Aquest ajut, dotat de 50,000 euros, es destina a petites i mitges empreses europees que inverteixin en projectes innovadors amb un gran impacte econòmic i social.

Sequentia presentarà oficialment a la comunitat científica aquesta revolucionària plataforma en la Plant and Animal Genome XXV Conference (PAG) – que tindrà lloc del 14 al 18 de gener en Sant Diego, Califòrnia (EUA)– la reunió d’agrogenòmica més gran i important del món, que reuneix anualment a més de 3.000 destacats científics i investigadors procedents de diferents àrees de la biologia molecular de plantes i genètica animal.

• Més informació sobre A.I.R.: http://www.transcriptomics.cloud