Un artículo publicado en la revista NAR Genomics and Bioinformatics presenta la Iniciativa Catalana para el Proyecto del Biogenoma de la Tierra (CBP), que forma parte del Earth BioGenome Project (EBP), una red internacional que quiere caracterizar la biodiversidad genómica de las especies en diferentes regiones del planeta. En esta iniciativa participan cerca de ciento cincuenta expertos de de varias instituciones de todos los territorios de habla catalana. La mayor parte de los genomas se secuencian en el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG), con sede en el Parque Científico de Barcelona.

Secuenciar el genoma de todas las plantas, los animales y los hongos en la Tierra —cerca de dos millones de especies conocidas— para proteger la biodiversidad tal como la conocemos. Este es el objetivo del Proyecto del Biogenoma de la Tierra (Earth BioGenome Project, EBP). En este ambicioso proyecto internacional, también participa la Iniciativa Catalana para el Proyecto del Biogenoma de la Tierra (CBP), que secuenciará los genomas de las especies eucariotas —es decir, con células que tienen el núcleo definido— que se encuentran en los territorios de habla y cultura catalanas (Andorra, Cataluña Norte, Islas Baleares, Comunidad Valenciana y Principado de Cataluña).

Ahora, la revista Nucleic Acids Research Genomics and Bioinformatics publica un article sobre la iniciativa CBP. El artículo tiene como autores a los catedráticos Montserrat Corominas, de la Facultad de Biología, el Instituto de Biomedicina de la Universidad de Barcelona (IBUB) y el Institut d’Estudis Catalans (IEC), y Roderic Guigó, del Centro de Regulación Genómica (CRG), la Universidad Pompeu Fabra (UPF) y el IEC.

En la publicación han participado muchos miembros del CNAG, como su director, Ivo Gut; la jefa de la Unidad de Secuenciación, Marta Gut; el líder del grupo de Genómica Comparativa, Tomàs Marquès-Bonet; el líder del equipo de Ensamblaje y Anotación del Genoma, Tyler Alioto; y la coordinadora estratégica del centro, Mònica Bayés.

El artículo pone en valor la rica biodiversidad de los territorios que han compartido históricamente una fuerte tradición cultural, con un legado lingüístico común, y hay que destacar que en él se menciona explícitamente la traducción catalana, disponible en la base de datos Zenodo [+].

Este trabajo sigue el precedente de otras publicaciones científicas sobre proyectos regionales dentro del EBP, como el Darwin Tree of Life (PNAS, 2022), la Coalición Portuguesa para la Genómica de la Biodiversidad (EcoEvoArXiv, 2023), el proyecto BioGenome de África (Nature, 2022) o el Proyecto Genómica de Conservación de California (Journal of Heredity, 2022).

Addressing the challenge of biodiversity genomics

La Iniciativa Catalana para el Proyecto del Biogenoma de la Tierra (CBP), fue impulsada en 2019 por la Sociedad Catalana de Biología (SCB), con el apoyo inicial de la Institución Catalana de Historia Natural (ICHN) y el IEC. Ahora, el proyecto también recibe financiación del Departamento de Investigación y Universidades de la Generalitat de Cataluña a través del IEC.

En este proyecto han participado cerca de ciento cincuenta expertos de instituciones como la UB, el CRG, el IBE-UPF-CSIC, el ICREA, el CNAG, el ICTA-UAB, el BSC-CNS, el CRAG, ICBIBE, CSIC-UIB y la IBB, entre otras. Biólogos, botánicos, zoólogos, genetistas, bioinformáticos, microbiólogos, ecólogos y otros expertos han contribuido con su esfuerzo investigador a una investigación que, de momento, tiene en el punto de mira la secuenciación del genoma de setenta y seis especies que se encuentran en los territorios de habla y cultura catalanas.

El papel del CNAG en esta ambiciosa iniciativa es obtener el genoma de referencia de todas estas especies, gracias a su experiencia de más de 10 años y a sus últimas tecnologías genómicas. Los resultados se pueden consultar en la página web de la CBP: https://dades.biogenoma.cat.

En la fase piloto de la CBP, iniciada en verano de 2020, se ha creado un catálogo digitalizado de las especies eucariotas que sitúan a Cataluña, con especies de taxones poco explorados, como el flagelado de agua dulce (Singekia montserratensis); especies raras, endémicas o difíciles de localizar, como el escorpión ciego catalán (Belisarius xambeui), o las consideradas emergentes como modelos biológicos, como el lagarto de pared (Podarcis muralis). También se quieren aportar los genomas de especies en peligro de extinción, como el tritón del Montseny (Calotriton arnoldi), el anfibio más amenazado de Europa, o el coral rojo (Coralium rubrum); especies usadas en medicina, como el botón de plata (Achillea ptarmica subsp. Pirenaica), o de interés económico, como el galán (Xyrichtys novacula).

Uno de los primeros genomas secuenciados es el de la pardela balear (Puffinus mauretanicus), una ave marina endémica de las islas Baleares, amenazado críticamente —especialmente por las capturas accidentales en palangreros—, según la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza (UICN).

Pero, más allá de las fronteras de los territorios de habla catalana, la CBP quiere formar parte de un movimiento transformador global para aumentar la conciencia social sobre la amenaza que genera la pérdida de biodiversidad para el bienestar humano, y potenciar una relación diferente y más equilibrada con la naturaleza en todo el mundo.

» Más información: web del CNAG [+]

» Artículo de referencia: Corominas, Montserrat; Marquès-Bonet, Tomàs; Arnedo, Miquel A. et al. The Catalan initiative for the Earth BioGenome Project: contributing local data to global biodiversity genomics, NAR Genomics and Bioinformatics, Volume 6, Issue 3, September 2024, lqae075, doi: 10.1093/nargab/lqae075